Агросистемы отличаются от естественных экосистем тем, что они всегда занимают большую площадь, чем естественные экосистемы. Растения в агросистемах часто выращиваются в монокультурах, что приводит к их угнетению и снижению биоразнообразия. Кроме того, агросистемы требуют дополнительных затрат энергии на обработку почвы, удобрения, орошение и другие агротехнические мероприятия, что делает их менее устойчивыми и экологически эффективными, чем естественные экосистемы.